Zakażenie wirusem zapalenia wątroby typu C (HCV) jest obecnie częste. Wielokrotnie donoszono, że wirus ten może mieć związek z etiopatogenezą chorób układowych tkanki łącznej, wśród nich – zespołu Sjögrena (ZS). Nie wiadomo jednak dotąd, czy wirus może być przyczyną choroby, czy do niej predysponuje albo czy jego obecność u chorych wynika z zagrożenia „statystycznego”. Objawy narządowe i zaburzenia serologiczne spowodowane zakażeniem HCV, a także związane z ZS są częściowo podobne, dlatego trudno odróżnić te sytuacje kliniczne. Równocześnie – zakażenie HCV w kryteriach klasyfikacyjnych z 2002 r. stanowi wykluczenie ZS, co budzi kontrowersje. Proponuje się więc określenia „prawdziwie pierwotny ZS” lub „ZS zależny od HCV”, a różnicę między nimi stanowi głównie obecność przeciwciał anty-Ro/SS-A i anty-La/SS-B, które znacznie częściej wykrywa się w postaci pierwotnej. Obecnie zaleca się sprawdzanie u wszystkich chorych z objawami chorób układowych tkanki łącznej, a w szczególności ZS, czy nie doszło do zakażenia HCV.